Kot poroča RTV Slovenija, je bil Marušič obtožen, da je spolno in psihično nadlegoval nekdanjo direktorico Študentskih domov Univerze na Primorskem, Astrid Prašnikar.
Do incidentov je prišlo leta 2015, pred rektorskimi volitvami, ko je Marušič kandidiral za ponovno izbiro za rektorja. Prašnikarjeva, ki ji je takrat iztekal mandat na čelu Študentskih domov, je bila takrat zsiljevana. V enem izmed srečanj pa je Astrid doživela neprijetnosti in neprofesionalno obnašanje s strani takratnega rektorja, ki ga je s telefonom posnela in posnetek predložila kot dokaz na sodišču.
Iz pogovora, ki je bil objavljen tudi na RTV, je razvidno, da je Marušič dejal:
„Moj odnos do tebe je večdimenzionalen, eno je kot ženska, eno je kot Astrid Prašnikar … jaz imam včasih v sebi malo bolj trdo mnenje glede tebe … potem prideš, tukaj sediš … razumeš … delujejo drugače te energije … tako da je nevarno v teh situacijah … midva se bova tako pogovarjala, jaz ti bom še nekako napolnil stotinko … stotinko flirtal … ti boš pa zdaj sodelovala s protikandidati … to ni primerno, ne … jaz imam eno zelo dobro misel o tebi, kaj bi lahko naredil v tem vmesnem obdobju, ne želim se tukaj izreči zaradi tega, ker vplivaš preveč … postanem nekje mehek … ma ne spodaj …“.
Sodišče je presodilo, da je Marušič do Prašnikarjeve izkazoval verbalno grobost, cinizem, jo šikaniral, mobingiral ter jo verbalno spolno in psihično trpinčil. Vse to je počel s položaja moči rektorja in nadrejenega.
Težave Astrid Prašnikar so se začele že leta 2012, ko je Marušič prevzel položaj rektorja. Takrat ji je začel zavračati izplačila potnih stroškov in nadur ter jo izključil iz univerzitetnih dogodkov, kot so seje.
